《柏林之狗》的故事中出现了两名截然不同的柏林警探，他们不情愿的组队协作，被迫与柏林黑社会争地盘，其间更要面对自己的人性弱点和犯罪行为，最后，他们必须做出终极决断：自己到底是执法者还是违法者。

女医生Babara（尼娜·霍斯 Nina Hoss 饰）因为企图从民主德国逃到联邦德国未遂，而被从柏林调遣到一所乡村医院工作，一开始她根本不和周围的人来往，直到医生Andre（隆纳德·泽荷菲德 Ronald Zehrfeld 饰）主动和她接近。医院里新送来一名女孩Stella，得的是脑膜炎，在Babara的细心呵护下逐渐康复。女孩却又因为怀孕了而被送去东德的劳教所。而另一方面，Babara在男友的帮助下积极准备下一次逃亡计划。虽然她还要不时地遭到东德警察的搜查，但是她隐藏得无懈可击。医院里又送来一名自杀未遂的男病人，Babara认为他需要动手术。Andre决定在周六晚上对这名病人进行手术，需要Babara的协助，而周六晚上正是Babara要进行逃亡计划的时间。正在她准备离开家的时候，Stella从劳教所逃出来找到了她.......

自从母亲死后，16岁的梅芙蒂和同父异母的兄弟姐妹们住在柏林，她富裕的父亲已经与另一个女人同居。然而梅芙蒂游戏人生：逃学，滥交，与人交恶，还因为结识奥菲利亚学会了吸毒，并与年长神秘的爱丽丝保持着一段关系。但是爱丽丝只是为了满足自己的需要，玩弄梅芙蒂的感情生活，留下梅芙蒂徒增伤悲。而自从她养了一只永远也长不大的蝾螈，她愈发对上学和身边的人失去了兴趣。

法医保罗自以为是的正义让他女儿惨遭绑架，他唯一的希望是困在无人岛上的漫画家琳达，她必须尽速代他执行一连串解剖且找到隐藏线索，才得以拯救保罗的女儿并揪出凶手。