草帽海贼团所向披靡，不过却遭遇了食物短缺的困境。众人饿得奄奄一息，不得动弹。路飞独自出行寻找食物，路上遭遇了邪恶的海贼“三日月”加林。加林原打算袭击某个平静祥和的海港小镇，谁想到半路招惹了路飞，结果被一网打尽。来到小镇的路飞被餐馆女孩希路克当作加林攻击，当得知对方只是来寻找食物时，希路克热情地接待了她。这个美丽的女孩有着曲折的身世，15年前这个小镇遭到毁灭性的打击，她作为海贼的孩子被遗弃在这里，而镇上的人民却不计前嫌收养了她。因此，希路克分外感激，决心不计一切保护小镇。不甘失败的加林率手下追到小镇，一场大战在所难免…

沙漠之国阿拉巴斯坦，虽然当地气候恶劣，但是国王寇布拉爱民如子，为了将国家建设成美丽的绿洲始终和百姓不懈努力。然而就在两年前，奇怪的现象离间了国王和百姓的关系。因为容易引起纷争，世界各国已严禁使用名为Dance Powder的降雨粉。但是阿拉巴斯坦曾大量购入Dance Power，在此之后，除国王所居住的阿鲁巴纳降雨正常外，该国其他区域全部为干旱所统治。一些民众认为寇布拉为己牟利，在克罗克塔尔的煽动下，反叛军揭竿而起，国家危在旦夕。寇布拉的女儿微微公主逃离国家，与路飞等人结伴而行。他们偶然遇见了会变换各种容貌的孟德勒，从而得知克罗克塔尔的阴谋。海盗团扬帆起航，向阿拉巴斯坦进军，一场沙漠大冒险就此展开……

阳光明媚，风平浪静，草帽海贼团的诸位正在享受着快乐时光，而就在此时，娜美却突然发起高烧，一病不起。为了治好她的病，众人扬帆来到拥有“常冬之岛”之称的医疗大国磁鼓王国。在当地人的指点下，路飞等人背着娜美上山寻找岛上唯一的魔女医生——吴羽博士。与此同时，一年前因战乱而弃国逃亡的瓦爆鲁带着邪恶的魔法师兄弟木修鲁卷土重来，他企图驱逐吴羽，重新统治这片土地。一时间战火重燃，盘桓在此的草帽海贼团被迫卷入其中……本片根据日本漫画家尾田荣一郎的同名原著改编，是2008年上映的第九部动画剧场版，也是漫画连载十周年的纪念作品。