在前往新世界的路上，草帽海贼团的各位悠哉游哉，举行了盛大豪华的时装秀。而就在此时，他们遭到比利奇准将所率领的海军的袭击，借着约瑟芬大炮的威力，草帽海贼团的船飞到了一座未知的小岛——手之岛。该岛形状像一只摊开的手掌，并且上面云集了来自全世界的能工巧匠。他们所制作出的手工艺品得到路飞、乌索普、布鲁克等人大为欣赏，但是手工艺品却十分短缺。因为这里的壮丁都被比利奇准将拉去修建海军基地，饱受压迫。路飞意外邂逅了雕蜡工匠杰高，既勾起了他童年的记忆，也知晓了手之岛的往事。比利奇准将不断膨胀的野心，必将为这座小岛带来一场前所未有的暴风雨……

草帽海贼团所向披靡，不过却遭遇了食物短缺的困境。众人饿得奄奄一息，不得动弹。路飞独自出行寻找食物，路上遭遇了邪恶的海贼“三日月”加林。加林原打算袭击某个平静祥和的海港小镇，谁想到半路招惹了路飞，结果被一网打尽。来到小镇的路飞被餐馆女孩希路克当作加林攻击，当得知对方只是来寻找食物时，希路克热情地接待了她。这个美丽的女孩有着曲折的身世，15年前这个小镇遭到毁灭性的打击，她作为海贼的孩子被遗弃在这里，而镇上的人民却不计前嫌收养了她。因此，希路克分外感激，决心不计一切保护小镇。不甘失败的加林率手下追到小镇，一场大战在所难免…

在一个风和日丽的日子，草帽海贼团正悠闲地在海上航行。突然，天空中出现一个漂浮的小岛，娜美及时通知各位规避即将到来的龙卷风，她的能力引起了小岛上海贼的注意。这个海贼首领非同寻常，他名叫金狮子史基，在大海贼时代到来前曾和哥鲁德•罗杰拼杀争霸。罗杰被俘后，史基也被投入海底监狱，但他却斩断双脚逃亡，并决心向东海展开复仇。史基意欲拉娜美入伙，双方不可避免发生纷争，经过一波三折，娜美最终落入史基手中。为了救出伙伴，并阻止东海毁灭计划，草帽海贼团将和史上最强大的敌人展开对决……本片根据尾田荣一郎同名原著改编，系《海贼王》的第十部剧场版动画，尾田荣一郎亲自担任制作总指挥。

ガイナックスによる人気ロボットアニメの劇場版「天元突破グレンラガン／紅蓮篇」に続く第2弾。大グレン団は螺旋族王四天王を撃破し、王都テッペリンにて螺旋王ロージェノムとの壮絶な一騎打ちを制したシモン。王都攻略後、瞬く間に文明を構築した人類だったが、宇宙にまでその手を伸ばしたとき、正体不明の敵が現れる……。